随着增值税专用发票管理的日益规范和逐步完善，现在较少有“善意取得虚开增值税专用发票”。税务机关在对购货方取得的已定性为虚开的增值税专用发票进行检查时，一定要慎用“善意取得虚开增值税专用发票”的定性。

近期，结合对购货方取得已定性为虚开的增值税专用发票抵扣进项税额这类案件的查处，笔者发现一种处理意见倾向为，只要从购货方取得证据支持有货交易，且未发现购货方明知取得的增值税专用发票系销售方以非法手段获得的，仍然向税务机关申报抵扣税款的，就一律定性为善意取得增值税专用发票，并按《国家税务总局关于纳税人善意取得虚开的增值税专用发票处理问题的通知》（国税发〔2000〕187号），以及《国家税务总局关于纳税人善意取得虚开增值税专用发票已抵扣税款加收滞纳金问题的批复》（国税函〔2007〕1240号）的规定，对不能重新从销售方取得合法、有效的专用发票的，只作出追缴其已抵扣的进项税额的处理决定，不予罚款和加收滞纳金。

国税发〔2000〕187号文件将善意取得虚开的增值税专用发票的内容范围界定为：“购货方与销售方存在真实的交易，销售方使用的是其所在省（自治区、直辖市和计划单列市）的专用发票，专用发票注明的销售方名称、印章、货物数量、金额及税额等全部内容与实际相符，且没有证据表明购货方知道销售方提供的专用发票是以非法手段获得的。”也就是说，善意取得虚开专用发票，需同时符合“四个条件”：一是购销双方存在真实货物交易；二是发票必须是销货方开给购货方的，且专用发票内容与实际交易相符；三是销售方使用的专用发票是其从所在省（自治区、直辖市和计划单列市）以非法手段获得的；四是没有证据表明购货方对取得的虚开发票事先是知情默许的。文件的出台，符合当时的管理环境，此文件是2000年11月16日下发的，当时防伪税控系统还未在全国全面推行，10万元版以下专用发票大部分还是手工票，所以存在销售方从所在省（自治区、直辖市和计划单列市）以非法手段获得的增值税专用发票，并以销售方的名义开具的条件。

但是，随着《国家税务总局关于推行增值税防伪税控系统若干问题的通知》的下发实施，2002年底完成了增值税防伪税控系统在全国范围的全面推行，自2003年1月1日起，所有增值税一般纳税人必须通过增值税防伪税控系统开具专用发票，同时全国统一废止手写版专用发票。自2003年4月1日起，手写版专用发票一律不得作为增值税的扣税凭证。自此，在发票发售环节，税务机关要将售票信息录入纳税人税控IC卡，并在开票环节实行自动比对，第三方即使以非法手段获得其他纳税人购买的增值税专用发票，也无法以第三方的名义开具。更何况，防伪税控系统报税子系统和国家税务总局、省局两级稽核子系统，还会对发票联和抵扣联的各项信息进行比对。所以，自2003年1月1日起，销售方再想利用从所在省（自治区、直辖市和计划单列市）以非法手段获得的增值税专用发票，并以销售方的名义开具这种手段进行规模化的虚开发票行为，已不可能。