问：某企业项目建设用地中含有铁路专用线区，按照耕地占用税减征项中含有铁路线路，请问这部分铁路专用线占地可否按铁路线路执行减征？计算耕地占用税时，是全部按照土地证列示面积计征，还是只按其中耕地部分计征？
答：《耕地占用税暂行条例》第四条规定，耕地占用税以纳税人实际占用的耕地面积为计税依据，按照规定的适用税额一次性征收。
第九条规定，铁路线路、公路线路、飞机场跑道、停机坪、港口、航道占用耕地，减按每平方米2元的税额征收耕地占用税。
根据实际需要，国务院财政、税务主管部门商国务院有关部门并报国务院批准后，可以对前款规定的情形免征或者减征耕地占用税。
《财政部关于对神—朔铁路占地征收耕地占用税问题的复函》（财税政字[1996]156号）规定，神华集团有限责任公司（原华能精煤公司）修建的神朔铁路，按照国务院国函[1995]75号文件确定的性质，属于企业经营的铁路专用线，根据我部[87]财农字第206号和[92]财农税字第37号文件规定，该铁路线路不属于免税范围，应照章征收耕地占用税。
依据上述规定，企业项目内的铁路专用线，不属于耕地占用税减征用地，应按当地适用税额缴纳耕地占用税。
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