分 析
      针对该学校的自查申报，稽查局有两种处理意见：
      第一种意见认为，该校符合《企业所得税法实施条例》第九十二条规定的“国家非限制和禁止行业，从业人数不超过80人，资产总额不超过1000万元”的小型微利企业条件，其申报2009年和2010年企业所得税时，以及本次自查后，按25％的税率缴纳企业所得税均系适用税率错误，作为稽查部门发现纳税人的这一错误后，应予以纠正：2009年原申报应纳税所得额2.8万元加上自查调增的0.8万元，合计3.6万元，应按《企业所得税法》第二十八条规定，减按20％的税率计征企业所得税0.72万元。其2010年原申报应纳税所得额2.2万元加上自查调增的0.6万元，合计2.8万元，依照《财政部、国家税务总局关于小型微利企业有关企业所得税政策的通知》(财税[2009]133号)规定，其所得2.8万元先减按50％计入应纳税所得额，再按20％的税率缴纳企业所得税0.28万元。该校已缴纳企业所得税1.25万元，多缴的0.25万元应退税。

      第二种意见认为，该校虽然符合小型微利企业的条件，原本2009年可以享受减按20％的税率计征企业所得税，2010年可以享受减半计算应纳税所得额再按20％的税率计征企业所得税的税收优惠，但是根据《国家税务总局关于印发《税收减免管理办法（试行）》的通知》（国税发〔2005〕129号）以及相关税收政策规定，小微企业减税优惠属于实行备案管理的减免税项目，该校没有办理备案，因此不能享受上述税收优惠，因此原按25％的税率缴纳的企业所得税1.25万元不能退还，而且对自查调整的金额还应继续按25％的税率补缴企业所得税0.35万元。

      建 议
      该校两年合计应纳税所得额6.4万元，已缴企业所得税1.25万元，而上述两种不同的处理意见，一种是要退税0.25万元，一种是要补税0.35万元，两者的差别达0.5万元，竟占到已缴税款的40％，而造成这一差别的原因就是小型微利企业优惠税率的适用不准确。

      鉴于现在正值2011年度企业所得税汇算清缴期间，稽查局立即向该校发出《税务稽查建议》，将该校在适用税率问题上的失误予以告知，提示该校在对2011年度企业所得税进行汇缴时，应按规定办理小型微利企业的认定手续，特别注意适用税率问题，在按规定办理好相关税务手续后，不但申报缴纳2011年度企业所得税时可以享受税收优惠，还能在2012年每季度直接按小型微利企业的优惠税率计算预缴企业所得税      本案中的纳税人因对税法缺乏了解，未能享受税收优惠，固然应自负其责；但是主管税务机关在接受纳税人申报时，未进行认真的审核，未及时纠正纳税人的申报错误，也难辞其责。在进行年度汇算清缴时，主管税务机关不但要审核纳税人的应税收入、扣除项目金额及应纳税所得额是否正确，还应注意审核适用税率的正确与否，不仅要把国家对小型微利企业的税收优惠政策向纳税人宣传好，更应将小微企业的减税减负政策落实到好。