当申报审核人员询问会计人员时，得到的回答是我们都是2007年以后新到公司的，老会计已经不在了，情况不清楚。项目组研究后，认为问题较严重，向总审作书面重大问题请示。

（2）疑点：总审分析认为，该项往来款究竟是经营收入还是非经营收入？往来款转收入，从所得税角度是经营收入和非经营收入对计税额没有影响，但是从流转税角度考虑经营收入和非经营收入税收待遇是不一样的，经营收入应纳流转税。

（3）复审意见：进一步取证，延伸到2003年往来款的确认证据。

2.事实根据之二：补证后申报审核结论——发生投资损失3500万元而不是投资收益
（1）初始投资

1995年3月北京A公司和马来西亚B公司分别向C公司投资人民币9500万元。

（2）投资收回

2002年8月23日终止公司经营，北京A公司2003年清算收回投资6000万元。

（3）会计确认的投资损失

A公司于2004年5月进行账务处理，确认股权投资成本总额人民币9500万元，实际收回投资6000万元，确认投资损失3500万元。

（4）“其他应付款——C公司”确认情况

2004年1-5月，由“C公司”转入A公司银行存款4300万元，经核减与“C公司”往来款后，A公司在确认支付清算费用1600万元，将余款2700万元在“其他应付款-C公司”中挂账处理。该款项实质为A公司代“C公司”管理的资产，其中包括“C公司”应付给马来西亚B公司的清算款项2700万元。

3.事实根据之三：投资损失税前扣除情况
经查实A公司2004年度-2007年度企业所得税汇算清缴申报等相关资料，“C公司”股权投资损失未在企业所得税税前扣除。

4.事实根据之四：资产损失发生年度的确认
上述证据要证明的事实，投资损失应在2008年确认。资产损失不是在发生的起点年度确认，而应在发生的截止年度确认。资产损失从发生到截止，有的在一个年度里完成，但多数是跨年度完成。现行的资产损失税前扣除，要求在发生年度扣除，不得提前或错后。怎样确认发生年度，是征纳双方经常存在争议的难点。按终点年度或截止年度确认发生年度，是因为只有在资产损失的终点，有关证据才能收集齐全，才有可能评价证据的确定性和充分性。经过证据取得（取证）、证据评价（评证）、证明事实（用证）等三个环节，证明了北京A公司的投资过程和投资损失的确认情况，结论是唯一的——投资损失确认金额800万元。

本案的投资过程。初始投资：1995年3月北京A公司向C公司投资人民币9500万元；持有投资：1995年3月至2002年8月；投资收回：北京A公司2003年清算收回投资6000万元；资产损失确认：自2002年下半年开始的企业清算工作至2008年才与外方协商确认执行清算协议的约定，历经七年。

（二）法律依据确认
根据《国家税务总局关于印发<企业资产损失税前扣除管理办法>的通知》（国税发[2009]88号）文件规定，投资损失鉴证案资产损失税前扣除的年度，应把握两个关键点：一是资产损失发生的年度，二是应履行报批手续。具体规定如下：

国税发[2009]88号第三条规定，企业发生的上述资产损失，应在按税收规定实际确认或者实际发生的当年申报扣除，不得提前或延后扣除。

因各类原因导致资产损失未能在发生当年准确计算并按期扣除的，经税务机关批准后，可追补确认在损失发生的年度税前扣除，并相应调整该资产损失发生年度的应纳所得税额。调整后计算的多缴税额，应按照有关规定予以退税，或者抵顶企业当期应纳税款。

国税发[2009]88号第四条规定，企业发生的资产损失，按本办法规定须经有关税务机关审批的，应在规定时间内按程序及时申报和审批。

（三）税收权利义务确认
如果按照个别证据提供的假象，形成投资收益2700万元，纳税人发生了纳税义务，应纳税额675万元。

如果按照鉴证结论全部证据所证明的事实，形成投资损失确认金额800万元，纳税人发生了资产损失税前抵扣的权利，减少纳税额200万元。

（四）合法性、合理性的判断
本案长期股权投资处置结果是损失还是收益，不存在自由裁量问题，应根据会计准则和税收制度确认。资产损失申报扣除年度应根据有关文件确认，同样没有自由裁量的空间。

就投资损失鉴证案来看，资产损失发生年度的确认及应履行的审批行为，均属于羁束行政行为，因此投资损失鉴证案的风险点是合法性问题，而不是合理性问题。

（五）实体法事项、程序法事项的判断
投资损失鉴证案交易事实的确认，纳税义务发生情况的确认，都属于实体法事项；投资损失鉴证案的会计处理、纳税申报、资产损失报批都属于程序法事项。

（六）风险点判断
投资损失鉴证案的风险点有三个，经营收入还是投资收益的判断风险，纳税义务和损失扣除权利的实体法风险，专项审批制度的程序法风险。

（七）风险级别判断
根据判断标准，本案属于高级别风险事项，一是合法性风险，征纳双方没有自由裁量或职业判断的空间；二是程序法风险，损失发生时间应确认在哪一年。

（八）风险防范措施
风险防范措施到位且有效，一是排除了合法性的争议，不是收益而是损失；二是排除了程序法的争议，损失发生在2008年，允许税前扣除。