2、暂估成本在汇算清缴期也要补充有效凭证。
对于期间费用在年度汇算清缴时必须取得有效凭证，并未有任何争议，而暂估成本是否必须要在汇算清缴期前取得，各省确有争议。34号公告明确无论成本项目，还是费用项目必须在汇算清缴时补充有效凭证，统一了政策。
但是在实际执行中仍会遇到困难，例如：2010年购入原材料价值3000万元，该公司采取加权平均法计价，购入原材料有1000万元到汇算清缴时仍未取得发票，该年度消耗该项原材料2000万元，运用约当产量法计算，其中还有300万元在“在产品”、“300万元”在“库存商品”，1400万元已经计入了“销售成本”。
那么当年调增所得额的话，到底按照多少调增呢？1000万元没有票的成本又有多少进入了“销售成本”呢？
方法1：直接纳税调增1000万元，简单化处理。
方法2：由于有发票的材料2000万元超过了计入销售成本的1400万元，认为入销售成本的，都是有发票的材料，因此不用调增。
方法3：按照加权平均的方法，调增1400万×30%调增。
究竟哪种方式，总局未做深入说明。个人以为，如果企业未取得发票的材料不是非常多的情形下，出于征管便利的考量，应该按照方法1简单化处理为宜，否则将会非常麻烦。
《刘晓伟回复张伟—
呵呵，我认为是方法2比较利于征管，并且还是简化处理。
齐洪涛回复刘晓伟—
刘老师：第二个观点存在的问题是企业永远取得不了发票，当年不调增，有可能以后年度检查时就发现不了此问题。
刘晓伟回复齐洪涛—
这个是值得表扬的实务经验。。。。。。这么多回帖的，就这个有水平。
但是税务机关没有证据证明是哪一批货物没有取得发票，企业说自己扣除的是取得发票的部分，没有取得发票的原材料一直就没有使用。税务机关该怎么办？不能因为库存一批没取得发票的货物就不能让当年的取得发票的不让扣除。
我坚持自己的观点，并在我局审理不少案件中持这种观点。只要有证据证明原料没耗用，就不用调增。》 

3、跨期取得发票的后续处理问题，仍未完全明确。
例如，2010年发生了一笔费用100万元，截止2011年5月31日之前，仍未取得发票，2011年企业对该笔费用做了纳税调整处理。
2011年8月该企业取得了100万发票，那么这100万元应当如何处理呢?
方案1：追溯调整至2010年，申请退税25万元。该方案的优点是完全符合“权责发生制”的基本理论，缺点是程序繁杂，退税不易。
方案2：直接扣除在2011年，在2012年1月-5月31号之前在企业所得税前做纳税调减处理。优点是简便易行，缺点是不符合“权责发生制”。

笔者倾向于方案2，虽然该方案不完全符合权责发生制，但是既然税法中很多条款出于证管便利了，变通了税法的一些原则，又为何不为纳税人提供该项便利呢？
当然企业如果有避税意图的，仍然要追溯调整，比如：减免税期间故意不去的扣税凭证的。笔者比较欣赏大连市的规定：一般应扣除在发票取得年度，如果因此而造成避税的除外。
千年龙点评—本人倾向方案1.依据权责发生制原则和征管法申请退税之规定。】