那么，A房地产企业究竟该如何处理？

　　1.房地产公司年度结账时，结转完工成本时，应该预提全部未取得的发票成本，该合同应预提1000万元建筑安装成本。会计处理为：借：开发成本——建筑安装成本1000万元；贷：应付账款——预提成本1000万元，至于企业所得税汇算清缴中的纳税调整则另行处理。

　　2.国税发[2009]31号第三十二条第一款规定，出包工程未最终办理结算而未取得全额发票的，在证明资料充分的前提下，其发票不足金额可以预提，但最高不得超过合同总金额的10%。因此，A公司结算计税成本时，可以列支未取得发票上的金额，但不得超过合同总金额的10%即8000×10%＝800（万元），超过部分的200万元应作纳税调整增加处理。

　　3.国家税务总局公告2011年第34号第六条“关于企业提供有效凭证时间问题”规定，企业当年度实际发生的相关成本、费用，由于各种原因未能及时取得该成本、费用的有效凭证，企业在预缴季度所得税时，可暂按账面发生金额进行核算；但在汇算清缴时，应补充提供该成本、费用的有效凭证。假设A公司不是房地产开发企业，根据该规定，A公司预提1000万元，如果能够在汇算清缴期间提供发票，则可以扣除，否则不得扣除。但国家税务总局公告2011年第34号并不仅针对房地产开发企业，也并非专指建筑出包工程。而国税发[2009]31号仅针对房地产开发企业结算完工计税成本适用，并非针对所有未取得发票的行为，例如房地产开发企业广告费未取得发票，预提时则应适用国家税务总局公告2011年第34号的处理。

　　4.适用国税发[2009]31号与适用国家税务总局公告2011年第34号并无矛盾，A公司预提的800万元适用国税发[2009]31号的规定，可以扣除，需作纳税调整的200万元工程款如果在汇算清缴期间取得发票也可以扣除。这样A公司该笔建筑施工合同8000万元的工程款可全部计入计税成本扣除。

　　5.如果汇算清缴期未取得发票，而在汇算清缴期之后取得发票，国家税务总局公告2011年第34号未提及此种情况下应该如何处理，但国税发[2009]31号第三十四条规定，企业在结算计税成本时，其实际发生的支出应当取得但未取得合法凭据的，不得计入计税成本，待实际取得合法凭据时，再按规定计入计税成本。

       因此，A公司200万元的发票，如果在汇算清缴结束后取得发票，仍可以扣除，但扣除年度为取得发票的年度。