会计处理
沿用《财政部关于印发〈外商投资企业采购国产设备退税和接受捐赠有关会计处理规定〉的通知》(财会〔2000〕5号)中的会计处理原则,可分以下几种情况进行会计处理:
1.购进货物
(1)如果在审批获准年度,货物尚未使用,或虽使用,但是产品尚未形成销售收入,则冲减存货的成本,借记“应交税金——应交增值税(进项税额)”科目,贷记“存货——原材料”、“存货——在产品”、“存货——产成品”等科目;

(2)如果在审批获准年度,货物已经使用,并在以前年度形成对外销售收入,则对以前年度的损益进行调整,借记“应交税金——应交增值税(进项税额)”科目,贷记“以前年度损益调整”科目;

(3)如果在审批获准年度,货物已经使用,并在审批获准年度形成对外销售,则对当年的损益进行调整,借记“应交税金——应交增值税(进项税额)”科目,贷记“主营业务成本”科目。

2.接受应税劳务
(1)如果是在审批获准年度的以前年度接受应税劳务,则对以前年度的损益进行调整,借记“应交税金——应交增值税(进项税额)”科目,贷记“以前年度损益调整”科目;

(2)如果在审批获准年度接受应税劳务,则对当年的损益进行调整,借记“应交税金——应交增值税(进项税额)”科目,贷记“主营业务成本”科目。

3.2009年1月1日后购进的符合进项税额可以抵扣条件的固定资产
(1)如果在审批获准年度,采购的资产尚未交付使用,则应冲减在建工程的成本,借记“应交税金——应交增值税(进项税额)”科目,贷记“在建工程”科目;

(2)如果在审批获准年度,采购的资产已在当年交付使用,则应相应调整固定资产的账面原价和已提的折旧,借记“应交税金——应交增值税(进项税额)”科目,贷记“固定资产”科目,冲减多计提的折旧,借记“累计折旧”科目,贷记“制造费用”、“管理费用”等科目;

(3)如果在审批获准年度,采购的资产已在以前年度交付使用,则应相应调整固定资产的账面原价和已提的折旧,借记“应交税金——应交增值税(进项税额)”科目,贷记“固定资产”科目,冲减多计提的折旧,借记“累计折旧”科目,贷记“以前年度损益调整”科目。

税务处理
1.增值税处理
国家税务总局2011年第50号公告规定,资料符合条件、稽核比对结果相符的逾期增值税扣税凭证信息,允许纳税人继续抵扣逾期增值税扣税凭证上所注明或计算的税额,即纳税人不会直接获得增值税退税,而是凭税务机关的审批资料,在增值税申报表上增加进项税额。

2.企业所得税处理
根据企业所得税法实施条例第九条的权责发生制原则,涉及“以前年度损益调整”科目变动的,不能更改审批获准年度的企业所得税年度纳税申报表。只能调整费用所属年度的应纳税所得额,所引起的应纳税额的增减,则在企业所得税年度纳税申报表主表“附列资料中的第四十一行或四十二行”中反映。

相关法规——
国家税务总局公告2011年第78号国家税务总局关于未按期申报抵扣增值税扣税凭证有关问题的公告