（一）报送资料
1.《代开货物运输业增值税专用发票缴纳税款申报单》（网上申请，一个网上文书序号打印一份《代开货物运输业增值税专用发票缴纳税款申报单》，一式一份，须加盖公章），临时户不能代开专用发票；
2.由付款方（或接受服务方）对运输服务项目、单价、金额等出具的书面确认证明复印件（加盖公章）（合同或证明金额超过10万元必须提供原件查验）；
3.申请代开发票人的合法身份证件原件；
4.税务登记证原件；
5.承包、承租车辆、船舶营运的，应提供承包、承租合同及出包、出租方车辆、船舶及营运资质的有效证明复印件（加盖公章）；
6.承运人自有车辆、船舶及营运资质的有效证明复印件（加盖公章）；
7.承运人同货主签订的承运货物合同或者托运单、完工单等其它有效证明复印件（加盖公章）（合同或证明金额超过10万元必须提供原件查验）；
上述所称车辆、船舶的有效证明，是指《中华人民共和国机动车行驶证》和《船舶所有权登记证》；运输单位营运资质的有效证明，是指《道路运输经营许可证》、《船舶营业运输证》。（提供复印件并加盖公章）
8.代开发票的应税劳务项目超过五项的（即六项以上），必须使用《销货清单》（一式三份），代开发票上的计量单位为“批”，数量为“1”，（销货清单价税合计，不得涂改且每页都要单独小计，最后一页再进行总计）。
 
（二）办理流程
1.登陆国税网站（www.szgs.gov.cn）,进入“办税服务厅—办税区—代开发票—货物运输业专用发票”模块，录入需开票的内容，保存后，需正式提交代开申请表，然后在“代开发票打印”模块勾选需要打印的《网上代开发票申请信息表》进行打印，并带上附报资料。
2.公司、个体户代开专用发票实行银税联网扣税办法，请在代开发票前将税款（含代征地税部分）存入公司的纳税账户。
3.二楼43-49号窗口代开发票，纳税人应在代开发票上加盖发票专用章。

（三）注意事项
1.小规模纳税人提供货物运输服务，接收方为一般纳税人，需要索取货物运输业增值税专用发票的，可向国税税务机关申请代开货物运输业增值税专用发票；
2.货运专用发票中“承运人及纳税人识别号”栏内容为提供货物运输服务、开具货运专用发票的纳税人信息；“实际受票方及纳税人识别号”栏内容为实际负担运输费用、抵扣进项税额的一般纳税人信息；“费用项目及金额”栏内容为应税货物运输服务明细项目不含增值税额的销售额；“合计金额”栏内容为应税货物运输服务项目不含增值税额的销售额合计；“价税合计（大写）（小写）”栏内容为不含增值税额的销售额和增值税额的合计；“机器编号”栏内容为货物运输业增值税专用发票税控系统税控盘编号，代开申请时不需要填写。