答:《财政部、国家税务总局关于土地增值税一些具体问题规定的通知》(财税字[1995]48号)规定,对纳税人既建普通标准住宅又搞其他房地产开发的,应分别核算增值额。不分别核算增值额或不能准确核算增值额的,其建造的普通标准住宅不能适用条例第八条(一)项的免税规定。
关于项目清算中不同开发品分别计算增值额问题。《重庆市地方税务局转发国家税务总局关于土地增值税清算有关问题的通知的通知》(渝地税发[2010]167号)规定,在清算项目中,房地产开发企业既建造普通住宅,又建造非普通住宅(非普通住宅包括:非普通住宅、车库、营业用房)的,纳税人必须按照不同开发品,分别计算扣除项目金额、增值额和增值率,缴纳土地增值税。否则,其建造的普通标准住宅不得适用免税规定。
依据上述规定,对一个清算项目中既有普通标准住宅又有非普通标准住宅不同开发品的,应分别核算增值额。普通住宅增值额为-100万元;非普通住宅(包括:非普通住宅、车库、营业用房)增值额-500万元(-1000+500),因此清算项目中非普通住宅无增值额,不需缴纳土地增值税。